موارد خفیف encephalitis معمولا به طور تدریجی و در عرض چند روز ظاهر شده و ممکن است فقط باعث یک تب خفیف و یک سر درد جزئی شود. با این حال در موارد شدید علائم معمولا به سرعت و در عرض 24 تا 72 ساعت یا 1 تا 3 روز بروز می کنند و عبارتند از:
1- تب بالا
2- سردرد شدید
3- ایجاد مشکلاتی در صحبت کردن مثل بریده بریده گفتن کلمات
4- ضعف یا فلج در یک یا چند قسمت از بدن
5- ضعف حافظه
6- از دست دادن شنوایی
اگر غشاهایی که مغز را پوشانده اند نیز دچار التهاب شوند مشکلات دیگری مثل سفت شدن گردن و عدم تحمل روشنایی زیاد نیز ممکن است بروز نماید. شخص مبتلا ممکن است دچار تشنج نیز بشود.
در بعضی موارد ابتدا فرد دچار گیجی می شود و سپس ممکن است خواب آلوده شود و به تدریج هوشیاری را از دست داده و به کما(اغماء) می رود.